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輕鬆一下～～

20090107Ghemical簡易教學

小朋友高高興興玩著程式設計(Scratch) 20081218

身為化工系畢業的我，已好久沒有接觸化學的東西了！之前在做「奈米」推廣時，想畫出C60巴克球的結構模型，一直找不到合適的軟體來製作，前幾天在「嘰哩呱啦ACE」看到一篇文章是介紹「3D化學繪圖Ghemical」 ，因此也就依樣畫葫蘆，很快就畫好了前陣子很紅的「三聚氰胺 (C3H6N6) 」，以下內容取自「嘰哩呱啦ACE」

一、簡介

• 由芬蘭的 Kuopio大學化學系所開發
• 是採用GNU GPL 授權的自由軟體
• 官方網站 http://www.bioinformatics.org/ghemical

二、軟體說明 (資料來源: Wekeywiki)

• Ghemical是3D化學繪圖軟體，這個程式可以在輸入原子種類、數量及鍵結條件之後，畫出分子的的立體結構圖。適合中學老師講解化學分子的立體結構，學生也可以自行練習。Ghemical也適合用在大學有機化學的課程，特別是講解穩定的分子構形與測量原子間的距離；對於大學生化課程， Ghemical可以輸入胺基酸或核酸，馬上可以看出立體結構。在Ghemical畫完圖後還可以存檔，內建格式是gpr。
• 同學們在上化學課時，可以用Ghemical等程式來幫助自己理解分子的立體結構，化學老師們也可以用Ghemical來進行教學。只要學會了基本操作，就可以享受Ghemical的便利！

三、教學活動體驗－畫出三聚氰胺 (C3H6N6) 的分子結構
＜＜本人的操作環境是在EZGO6下的Ghemical 2.95＞＞

1. 在作圖區中任一處按滑鼠右鍵，在跳出式選單中，選擇 Render => Label Mode (標籤模式) => Element (元素)，這樣等一下畫原子的時候會標示出元素名稱。
2. 先在心裡面想著要在作圖區畫一個六角形，假設六個頂點為1、2、3、4、5、6。
3. 點一下工具列最左邊的鉛筆 d (draw)， Ghemical預設是畫碳原子。
4. 在作圖區中你想像的六角形頂點 1,3,5的位置點三下，這將會畫出三顆碳原子，稱之為 C1、C3、C5。

5. 點一下工具列中的週期表 el，在週期表中選N(氮)。

6. 在作圖區中你想像的六角形頂點 2、4、6的位置點三下，這將會畫出三氮原子，稱之為 N2、N4、N6。

7. 從六角形中的三個碳原子向外分別再畫出三個氮原子。

8. 點一下工具列中的原子鍵類型 bt (bond type)，再點一下Single(單鍵)，在C1上按滑鼠左鍵不放，拉到N2後放開，這將會畫出一個單鍵，請依序用單鍵連結 C3和N4、C5和N6、及從三個碳原子分別連向六角形外的三個氮原子。。

9. 點一下工具列中的原子鍵類型 bt (bond type)，再點一下Double(雙鍵)，在C1上按滑鼠左鍵不放，拉到N6後放開，這將會畫出一個雙鍵，請依序用雙鍵連結 C3和N2、C5和N4。

10. 在作圖區中任一處點滑鼠右鍵，在跳出式選單中，選擇 Build => Hydrogens => Add，Ghemical將會自動補上氫原子。

11. 在作圖區中任一處點滑鼠右鍵，在跳出式選單中，選擇 Compute => Geometry Optimization (幾何位置最佳化)，Ghemical將會自動計算出原子之間的距離和角度。

12. 點一下工具列中的運行軌道 o，然後對著三聚氰胺分子按滑鼠左鍵不放，稍微拖曳一段距離後，放開滑鼠左鍵，這樣就可以感受到化學分子的立體感！

真是一套蠻不錯的軟體！！

四、網路資源

• 笨牛OpenOffice.org 與自由軟體在中學課程之應用 PDF檔第37-44頁
• 洪朝貴 Ghemical 幫您認識毒奶粉

五、後續

在洪老師的文章中，引來很多共響與回饋，更感謝笨牛前輩在這方面的付出與貢獻，雖然我是國小老師在「化學結構式」方面應該是無用武之地，但我會發出聲音，讓大家知道有很多人在這方面默默的耕耘，也希望教育當局能看到這些人的努力，提供更多資源，更有系統的導入這方人的成果到教育現場，也可免去學生覺得「化學式」的枯燥乏味，進而抹殺了學習興趣！其中笨牛說到：「 Avogadro 太棒了, 若 Ghemical 有 70 分, 那 Avogadro (亞佛加厥) 有 98 分. 我想我會暫時放棄 Ghemical」

• 首頁http://avogadro.openmolecules.net/wiki/Main_Page
• 下載: 跨平台, 微軟及蘋果使用者也可用http://avogadro.openmolecules.net/wiki/Get_Avogadro

有空時，再來玩一下這套Avogadro～～拭目以待

岩石與礦物

新的一年新氣象，本部落格也會在每一篇文章隨機擺上一張生活相片 ，並秉持至少每週一文。

20081227學校運動會，學生開心的看著表演

這學期五年級自然（南一版）最後一個單元就是－岩石與礦物，我對這部分一竅不通，剛好藉此機會「從教中來學」，大概整理了一些重點，當作以後教學的參考，如下：（以下圖片取自遠足文化出版的「台灣的岩石」，作者：吳文雄、楊燦堯、劉聰桂）

一、岩石分成三大類：

1. 火成岩：高溫岩漿，噴發出地表或在地下降溫冷卻，凝固後所形成的岩石。
2. 沉積岩：岩石經風化、侵蝕作用或動植物的遺骸所形成的沉積物，經過膠結與深埋作用而成的岩石。
3. 變質岩：岩石因深埋地下，受溫度、壓力增加，造成原有岩石的礦物種類、岩石排列或結構改變而形成的岩石。

二、火成岩，依照岩漿凝固的狀態，又可以分成：

1. 在地下深部固結的「深成岩」（未噴出），如花崗岩
2. 經火山作用噴出或從裂縫流出地表才冷卻形成的火山熔岩，如安山岩（在陸上噴出）、玄武岩（在海底噴出）

三、沉積岩，除上述外，也有是由化學作用（鐘乳石）或生物作用（石灰岩）所形成，台灣常見的有：礫岩、砂岩、頁岩（泥岩，主要成分是黏土）、石灰岩

四、變質岩：受高溫高壓影響，這高溫高壓的變化可能是地殼運動或岩漿侵入作用造成，造山帶是變質作用主要地區，如青康藏高原與中央山脈。台灣常見的有：變質砂岩、板岩、片岩、片麻岩和大理岩(從石灰岩變質而來）

常見的造岩礦物：

組成岩石的礦物，稱為造岩礦物，以火成岩的造岩礦物為主，主要的造岩礦物可分成二大類：

1. 非鐵鎂質矽酸鹽礦物：主要的金屬離子是鈉、鉀、鈣、鋁等，像石英、長石、白雲母
2. 鐵鎂質矽酸鹽礦物：黑雲母、角閃石、輝石、橄欖石等礦物，合有較多的鐵與鎂成分，比重較大，顏色也較深。

目前地球上的已知礦物有二千多種，但是主要的造岩礦物只有十幾種，常見的有：

1. 石英：化學成分是二氧化矽，屬六方晶系，具玻璃光澤。具良好且透明的六角尖柱狀結晶外形的石英稱為水晶。工業上常拿來製造玻璃的主要原料，或作計時震盪器。
2. 長石：分正長石（單斜晶系）和斜長石（三斜晶系）二類，具玻璃光澤。長石與石英外觀相似，長石具有兩組良好的解理，而石英則不具解理。長石是火成岩的主要組成礦物。
   ＊ 花崗岩內灰白或肉紅色的礦物顆粒大多正長石。
   ＊ 安山岩中，斜長石常呈白色斑晶。
   ＊ 玄武岩中，斜長石常呈細長的晶體。
   長石風化後大多形成高嶺土，是瓷器的原料。　
3. 雲母：分為淡色的白雲母（單斜晶系）與中黑色（單斜晶系）的黑雲母兩大類。最主要的特徵就是容易剝成一張張的薄片，因為它具有一組非常發達的解理。結晶良好的雲母成六角片狀，顏色差異主要是因為後者的鐵、鎂含量較高所致。黏土礦物受成岩作用而重新結晶可形成雲母；頁岩或泥岩在變質過程發生雲母的再結晶作用，使雲母顆粒增大。白雲母具絕熱與絕電的特性，是很好的絕緣材料。
4. 角閃石與輝石：二者均為鐵鎂質矽酸鹽礦物，但結構不同。前者的矽－氧（SiO4)四面體連結成雙鏈狀，後者為單鏈狀，硬度相似，具玻璃光澤。同樣具有兩組發育良好的解理，不易區分，結晶外形及兩組解理夾角是區分的重要方法（前長柱狀、60度；後短柱狀、90度）。兩者都是火成岩或變質岩常見的礦物，安山岩中的黑色斑點，大部分就是輝石或角閃石。
5. 方解石：是碳酸鹽類的礦物。有時與石英相似，可以稀鹽酸測試分辨。硬度小。方解石是石灰岩與大理岩的組成礦物，用此兩者為裝潢石材時，要注意不耐刮磨問題，也勿使用稀鹽酸清潔這些石材。
6. 黏土礦物：黏土礦物是矽酸鹽礦物風化的產物。有很多種，典型的特徵是顆粒都非常細小。最常見的是高嶺石。膨潤土是較特別的黏土，火山灰之類風化後的產物，吸水後會大量膨脹。

ＰＳ：解理：當礦物受到敲擊時，容易循一定的方向裂開來，這種特性稱為「解理」，如上述的「白雲母」

礦物的硬度：硬度是指礦物受損的難易程度，兩塊礦物互相摩擦，受損的一塊硬度較低。

• 課本教的礦物硬度比較：石英（7）＞方解石（3）＞雲母（2.5～3）＞硫磺（1.5～2.5）＞石墨（1～2）＞滑石（1）
• 莫氏硬度表：

後續：

整理了這篇文章之後，很慚愧的是：如果隨便拿一顆岩石要我辨識，我可能還是無法知道這是什麼岩石！！但至少我已懂得一些入門知識了～～

「神奇blog之旅」教學成果省思

一、 課程實施情形：

本學期所規畫的課程是「神奇blog之旅」，主要是教導學生如何使用Google的Blogger來經營自己的部落格，並藉由部落格的教導來認識Google家族中的好用軟體及強大的網路功能，如下：

• GMAIL：由於學生即將畢業，之前教導的EMAIL是架設在學校之下，學生畢業後帳號將給予刪除，為讓學生能擁有一帶得走且好用的MAIL，方便學生以後的互相交流，因此教導學生使用GMAIL！而且有此帳號後，Google的各項網路功能均可使用。
• Blogger：這是本學期的重點，讓學生擁有並且經營自己的部落格。只見有些學生利用它來進行文章、繪畫創作、心情舒發、彼此交流…
• Google地球：透過由太空來看地球，從空中來找到台北101大樓、學校、自己的家
• Google天際：利用「夏季認星歌」來學習夜晚的星空及星座
• Picasa相片管理軟體及網路相簿：利用上課時間快速幫每一位學生照相，然後透過Picasa相片管理軟體的處理，並將相片放到網路相簿，給學生做永遠的回憶。
• Google地圖：讓學生做路線規畫及繪製我的地圖，並將地圖放到部落格上。
• Sketchup3D建築物繪製：利用本軟體來繪製3D建築物，並將畫好的sketchup圖放到部落格供大家欣賞。

由於Google的功能相當多，因此很多功能都只用一節課帶過，除了讓學生認識基本功能外，並鼓勵學生自動探索各種功能的奧秘～～

二、 課程實施成效：

由於學生要畢業了，所以我將重點著重在一個「以後20年內」還可以繼續使用的MAIL，並建立全班的通訊錄，方便學生畢業後還可互相連絡。有關於這點的實施成效，可以說達「百分之百」，每位學生都成功的註冊了GMAIL，並且藉此MAIL通信、交談，當然有極少數的學生會忘掉帳號、密碼，因此又灌輸了，連一組「帳密」都管不好，以後如何能成就事業？

有了GMAIL帳密後，就要求學生申請Blogger，並經營自己的部落格，要求學生寫下值得回憶、感動及生活上的事項，當然有很多學生都只是應付了事，但大部分都是很用心－有的把部落格當成創作園地，當起小作家來；有的把部落格當成畫布，當起小畫家來；有的把部落格當成相簿，用相片來寫日記；有的把部落格當成專題，用來寫老師派的專題作業；更有的把部落格當成交流園地，進行各項有趣的投票…更有學生說：感謝老師教他們使用部落格！

除了GMAIL、部落格的教學外，另一個重點就是Google的強大網路功能及好用的免費軟體的介紹，尤其在Google地球、地圖－可以融入社會領域教學；Google 天際可以融入自然領域教學；sketchup可以融入數學領域教學，這些軟體對於學生的自學都很有幫助～

三、 課程教學省思與回饋：

Google是目前最有影響力的網路公司之一，他提供了很多免費好用的軟體及強大的網路功能，因此本著「好東西與好朋友分享」的心情來教導學生這方面的資訊！由於我的學生都是六年級的，我希望學生們在學習電腦方面的技能，不再是老師說一項學生做一項，而是希望學生能主動求知、勇於探索各種新功能！因此在教學時，由於時間有限，所以我會先將入門的、好用的、基本的功能先跟學生做說明，學生除了可以模仿老師的方式來製作外，也鼓勵學生自己探索老師沒有教過的東西、追求新知！另外，我也發現「班級風氣」在學生的資訊課，也影響很大！老師可以從學生的部落格發現：整體而言，表現好的班級，學生的部落格整體都不錯（表現好多於表現差者）；比較不好的班級，學生在經營部落格就比較不用心，甚至連一篇文章都沒有（表現差多於表現好者）！因此除了考慮「教學進度」外，也要注意「班級資訊風氣」的營造，注意少數表現不佳者影響全班的學習風氣～

心智圖簡介

如何來「畫」心智圖呢？

心智圖繪製規則：

• 空白紙。
• 紙橫放。
• 中央開始。
• 彩色圖表示主題。
• 字體要端正。
• 字在線上方。
• 慎選關鍵字。
• 誇張有趣

心智圖繪製常犯的錯誤：

• 未從中央開始。
• 字跡潦草。
• 字未在線上方。
• 錯字塗改。
• 關鍵字使用不當

96學年度4年11班心智圖作品（昆蟲）

http://picasaweb.google.com.tw/shspswenyu/20080421

相關的電腦軟體：

• 歐展嘉老師的FreeMind心智繪圖軟體教學錄影http://163.20.160.21/xoops22/t167/FreeMind/list.htm
  http://km.tyes.tpc.edu.tw/f2blog/index.php?load=read&id=176
  
• 免費美觀又好用的心智圖軟體 — Cayra
  Cayra 0.9.5 Freeware
  官方網站：http://cayra.net/
  下載點：http://cayra.net/download
  適用作業系統： Windows XP/Vista (需要 .Net Framework 3.0)
• Keystone 是由大陸朋友所開發的心智圖繪製軟體，可切換中文簡、繁與英語版。原作者的網站 就展示了用Keystone繪製的概念圖。

還有可以直接線上來畫心智圖，參考「線上無料心智圖軟體 ㊣軟體玩家」，我並且到了Mind42註冊，利用線上來玩玩！另外，又有一篇「把文字轉成心智圖的網站」，利用「階層」所做出來的「文字」，可以轉成心智圖！

參考資料：

• 取自林朝敏老師
• 歐展嘉的教學網有動態影像教學內容
• 腦袋亂糟遭! 好用的心智圖軟體 Freemind幫忙你!
• 研究專題辦法說明
• 心智圖法 作品欣賞
• 應用心智圖寫作
• 心智圖

20081129 NAT+XOOPS伺服器架設（實作）

8月份利用IBMx206m所安裝的CC1NAT伺服器，感覺網路速度並不是很快，而且網頁都是以西歐編碼，造成網頁的亂碼！這次有機會再購買了一台伺服器（Dell PowerEdge T300)，因此再利用它是架設NAT，測試看看！（上次的架設文件：http://ssgogogo.blogspot.com/2008/08/20080806.html）

• 伺服器：Dell PowerEdge T300（CPU：雙核心Xeon E3113）
  
  



• SATA 磁碟陣列卡：SAS 6/iR控制器（插在PCI-E插槽，驅動程式在光碟片，英文手冊有安裝及操作說明），出廠時就已安裝好RAID 1（鏡射）






• SATA硬碟：二顆（各250GB），採用RAID 1
• 安裝系統：CentOS5.2

一、開機畫面

二、CentOS安裝

• 安裝時，並沒有出現「磁碟」問題（須驅動RAID卡的問題），磁碟直接出現『Dell VIRTUAL DISK」來安裝，但用掉了sda1與sda2（vfat的格式）
• 磁碟規畫
  /boot 200MB
  SWAP 2048KB
  /usr 20GB
  /var 60GB
  /home 100GB
  / 50GB

三、昇級及補強

• 快速安裝及修正自動昇級套件之設定之檔案來源ftp://ftp.kh.edu.tw/pub/APPL/yum/FC8/fix-yum-CentOS5.sh
  其餘項目按手冊來逐一進行
• 有一修改處，將PROXY改為資教中心，減少下載時間，如下：
  增修/etc/yum.repos.d/rpmforge.repo
  在最後加上下面二行：
  proxy=http://open.kh.edu.tw:3128/
  timeout=300

四、安裝DHCP Server

• 編輯 /etc/dhcpd.conf 檔，由於有將舊電腦的此檔給備份下來，所以就直接取代此檔！
• 從電腦教室的電腦進行測試，看是否可以取得一組IP～～
• 並無發生任何問題

五、簡易NAT架設

• 最簡單NAT的設定：（eth0:對外163.32.244.X 、eth1:對內192.168.0.0）
• #echo "1" > /proc/sys/net/ipv4/ip_forward
• #iptables -t nat -A POSTROUTING -s 192.168.0.0/24 -o eth0 -j MASQUERADE （最簡單的方式）
• #vi /etc/rc.d/rc.local （上面二行加入到rc.loacl)
• #chkconfig iptables on (重新啟動iptables)
• 從電腦教室的電腦進行測試，是否可以連到外面去～～
• 並無發生任何問題

六、phpMyAdmin的安裝

• 因mySQL系統預設並沒有密碼，所以在啟動MySQL後，必須馬上修改MySQL的密碼，以免遭到別人闖入利用！修改MySQL的密碼：
  # mysqladmin password 新密碼
• 下載phpMyAdmin （目前版本：3.0.1及2.11.9.2(phpMyAdmin-2.11.9.2-all-languages.tar.bz），但3.0.1版須要php5.2以上的版本才可安裝，CentOS5.2內建的是php5.1.6(下php -v就可查到版本），所以只好安裝2.11.9.2版）
• 解壓縮放到 /var/www/html 下
• 由於設定過程有些複雜，還是看資教中心的技術文件＜PHP及MySQL的安裝與管理＞
• 我直接去下載IBM那台伺服器的config.inc.php檔（直接在phpMyAdmin目錄下），也可用網頁設定工具https://IP/phpMyAdmin/scripts/setup.php
• 因為我們使用的文字大多是繁體中文，為了讓phpMyAdmin能確實辨認雙位元字，必須先檢查是否安裝php-mbstring套件。
  # rpm -qa grep php-mbstring
  若沒有安裝，則請先安裝php-mbstring套件：
  # yum install php-mbstring
• 另外，檢查有無安裝php-gd
  # rpm -qa grep php-gd
  若沒有安裝，則請先安裝php-gd套件：
  # yum install php-gd
• 進入phpMyAdmin，改用加密(https)的方式來連線https://IP/phpMyAdmin
• 如何將php5.1.6升級到5.2以上
  參考資料：http://memorandum.yamasnet.com/archives/Post-165.html
  執行以下指令：
  # wget http://download.fedora.redhat.com/pub/epel/5/i386/epel-release-5-2.noarch.rpm
  # wget http://rpms.famillecollet.com/el5.i386/remi-release-5-4.el5.remi.noarch.rpm
  # rpm -Uvh remi-release-5*.rpm epel-release-5*.rpm
  # yum –enablerepo=remi update php*
  我執行到第4個步驟，無法成功！！

七、舊資料移植

• 移植 /var/www/html內的所有資料
  # tar zcvf html.tar.gz html (在/var/www下）
• 移植 /var/lib/mysql內的所有資料
  # tar zcvf mysql.tar.gz mysql（在/var/lib下）
• 移植其他帳號下的資料

20081126電腦教室更新案

電腦教室更新
零、電腦基本配備：

• 廠牌：ACER
• 型號：Veriton M460
• CPU：Intel Pentium Dual CPU E2200@2.2GHz
• 記憶體：2G DDR2
• 硬碟：250GB SATA

一、建置多重開機系統（利用蓮騰復活卡）

• WinXP
• Vista（僅有分割空間，未安裝）
• EZGO6
• 

二、軟體安裝

• 一般軟體
• 自由軟體
• 注意事項：

三、廣播系統：

• 仍然用之前的廣播系統
• 剛開始時，由於部分幾台線裝錯了，導致廣播系統無法顯現電腦，經過檢查後，終於OK了
• 由於沒有使用之前三茗的衛士還原卡，而復活卡又無管理系統，對於經常使用「統一」開機及關機的我很不習慣，原本要去找相關的軟體來替代，但一直沒有找到合適的！最後，發現原本三茗的管理系統，在我修改要開機電腦的MAC後，發現它仍可以「遠端開機」，但無法「遠端關機」！我再利用時間找到了一套lantool 0.2.2發現它可以「遠端關機」，還可以「傳檔案與訊息」！安裝時。老師機做完全安裝，學生機只做基本安裝（其他選項均不勾選），連在程式集也不要它出現！！